今天我们要看的文章主角是索尔(THOR),不过此THOR非彼THOR,
是一条最新发表在Cell杂志上的lncRNA:
OncogenicRoleofTHOR,aConservedCancer/TestisLongNon-codingRNA.Cell.Dec4;7(7):-.e20.
我们今天要看的就是这篇文章,与往常不同的是,我们把知识点摘出来分条看。
这是文章的GraphicalAbstract。
.THOR的命名:lncRNA的命名我们专门写过一期:(策略篇)lncRNA命名的五种方式。THOR(ENSG)是这么缩写来的:Testis-associatedHighlyconserved
Oncogeniclongnon-codingRNA,当然除了THOR外,有意思的名字还有:HULK(HUA2-LIKEgene)、SUPERMAN、SleepingBeauty、Yin-Yang甚至所谓的麻辣烫(MALAT)等等,大家喜欢把自己新发现的基因进行命名,这也算是科研的一些乐趣吧。嗯,我们下次命名一条lncRNA叫雷震子(LZZ),就是这么任性。
2.THOR的发现:关于lncRNA的基本生物学特性的研究,我们列举过一个“八部天龙”:
()lncRNA的疾病差异表达;
(2)lncRNA与周围基因关系;
(3)RACE明确lncRNA序列
(4)lncRNA在细胞内的定位(空间特异性);
(5)lncRNA在组织内表达特异性;
(6)lncRNA表达的时间特异性;
(7)lncRNA编码蛋白能力预测和验证;
(8)lncRNA的物种保守性;
在这篇文章里面,关于THOR的各部分基本都展开了:
需要特别注意的是THOR的发现主要是从(8)物种保守性展开的:保守性决定序列、序列影响结构、结构影响功能,更直观地理解就是一个基因在物种里面越保守,其功能越重要,因为发生变异的个体在进化中被淘汰了。THOR的物种保守性非常好:
查询保守性我们也写过