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TUhjnbcbe - 2021/2/14 7:13:00

今天我们要看的文章主角是索尔(THOR),不过此THOR非彼THOR,

是一条最新发表在Cell杂志上的lncRNA:

OncogenicRoleofTHOR,aConservedCancer/TestisLongNon-codingRNA.

Cell.Dec4;7(7):-.e20.

我们今天要看的就是这篇文章,与往常不同的是,我们把知识点摘出来分条看。

这是文章的GraphicalAbstract。

.THOR的命名:lncRNA的命名我们专门写过一期:(策略篇)lncRNA命名的五种方式。THOR(ENSG)是这么缩写来的:Testis-associatedHighlyconserved

Oncogeniclongnon-codingRNA,当然除了THOR外,有意思的名字还有:HULK(HUA2-LIKEgene)、SUPERMAN、SleepingBeauty、Yin-Yang甚至所谓的麻辣烫(MALAT)等等,大家喜欢把自己新发现的基因进行命名,这也算是科研的一些乐趣吧。嗯,我们下次命名一条lncRNA叫雷震子(LZZ),就是这么任性。

2.THOR的发现:关于lncRNA的基本生物学特性的研究,我们列举过一个“八部天龙”:

()lncRNA的疾病差异表达;

(2)lncRNA与周围基因关系;

(3)RACE明确lncRNA序列

(4)lncRNA在细胞内的定位(空间特异性);

(5)lncRNA在组织内表达特异性;

(6)lncRNA表达的时间特异性;

(7)lncRNA编码蛋白能力预测和验证;

(8)lncRNA的物种保守性;

在这篇文章里面,关于THOR的各部分基本都展开了:

需要特别注意的是THOR的发现主要是从(8)物种保守性展开的:保守性决定序列、序列影响结构、结构影响功能,更直观地理解就是一个基因在物种里面越保守,其功能越重要,因为发生变异的个体在进化中被淘汰了。THOR的物种保守性非常好:

查询保守性我们也写过

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